تاسیس: در سال 1360 با عنوان هسته گزینش سازمان منطقه ای بهداشت و درمان استان سیستان و بلوچستان و دانشگاه علوم پزشکی زاهدان.
در سال 1365 دانشگاه علوم پزشکی سیستان و بلوچستان تأسیس شد و از آن زمان تحت عنوان هسته گزینش دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی استان سیستان و بلوچستان به کار خود ادامه می دهد .
هسته گزینش دانشگاه علوم پزشکی زاهدان تا سال 1372 به مدیریت آقای حاج محمد رضا سعادت و از سال1372 تا سال 1390به مدیریت آقای حاج عوضعلی میری کرباسکی ، از اوایل سال 1391به مدیریت آقای حاج محمد سنچولی و از سال 93 به مدیریت خانم رضائیان و از 98/4/17 با مدیریت جناب آقای مهندس احمد بامری و از شهریور سال 1400 با مدیریت جناب آقای مهندس علیرضا حسینی اداره می گردد.